Beethovenin jatko-osassa Beethovenista tulee ylpeä isä, kun Beethoven ja tämän unelmien narttu Missy lyövät hyntyt yhteen. Missyn omistaja Regina aikoo itsekkäästi käyttää pentuja aseena eroa kaavaillessaan. Newtonin perheen lapset eivät jää neuvottomina seisomaan pentujen ollessa uhattuina vaan päättävät pelastaa ne.